La Commission nationale est présidée par le Ministre en charge du département auquel le rattache le décret N°2009-459 du 07-05-2009 portant répartition des services de l’Etat et du contrôle des établissements publics, des sociétés nationales et des sociétés à participation publique entre la présidence de la république, la primature et les ministères. Il s’agit du Ministère de l’Enseignement préscolaire, de l’Elémentaire, du Moyen secondaire et des Langues nationales.
Son organe exécutif est le Secrétariat général permanent est dirigé par un Secrétaire général nommé par décret sur proposition du Ministre, Président de la Commission nationale.
Le Secrétaire général coordonne les activités des divisions qui recoupent les domaines de compétences de l’UNESCO : Education ; Culture ; Information-Communication ; Sciences humaines et sociales ; Sciences exactes et naturelles ; Formation et documentation, Ecoles associées, clubs UNESCO et relations avec les organisations non gouvernementales.
Il a aussi en charge la coopération avec l’Organisation islamique pour l’Education, la Science et la Culture (ISESCO).
| Président | M. Kalidou DIALLO, Ministre | Secrétaire général | M. Moustapha TAMBADOU |
| Secrétaire général adjoint, | M. Aliou LY |
| Chef de la Division ISESCO | M. Amadou DIABY |
| Chef de la Division Education et de la Formation | Mme LY Fatoumata SIGNATE |
| Chef de la Division des Sciences naturelles | Mme DIA Aminata COULIBALY |
| Chef de la Division des Sciences exactes | M. Mamadou Ndiaye DIA |
| Chef de la Division Sciences humaines et sociales | M. Tamsir Birane NDIAYE |
| Chef de la Division des Ecoles associées, Clubs Unesco et ONG | Mme SECK Fatou Dramé NIANG |
| Chef de la Division Communication et Information | M. Maki DIALLO |
| Responsable du Centre de Documentation | M. Jupiter YADE |
| Chef du Bureau du Courrier | M. Karamo DRAME |
| Secrétaire | Mme Ngoné SECK |
| Secrétaire | Mme DEMBA Aminata DIAGNE |
| Intendant | M. Samba NIANG |
| Chargé de Mission | M. Omar GAYE |